Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CEP290-202ENST00000397838 2421 ntTSL 5 BASIC1.6□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AL137072.1-201ENST00000603444 466 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AC022960.2-201ENST00000616300 666 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
ATRQ13535 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
ATRQ13535 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
ATRQ13535 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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