Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 FGF7P8-201ENST00000402994 292 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TCOF1Q13428 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
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TCOF1Q13428 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
TCOF1Q13428 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
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