Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SLC5A3-201ENST00000381151 11576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPA4Q13156 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms