Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC058791.1-201ENST00000608412 3198 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
FOXD4Q12950 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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