Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

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Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 NAP1L1P1-201ENST00000524793 1063 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ATRXP46100 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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