Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 HMGB1P31-201ENST00000437242 427 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
PTPRMP28827 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRMP28827 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
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