Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC004990.1-201ENST00000431722 564 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 DAZ2-203ENST00000382424 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
PTPREP23469 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
PTPREP23469 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
PTPREP23469 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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