Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC2□□□□□ -2.09
J3QKU1 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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J3QKU1 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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J3QKU1 CEP70-205ENST00000464035 1054 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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J3QKU1 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
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J3QKU1 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
J3QKU1 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
J3QKU1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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