Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RNU6-549P-201ENST00000384433 107 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
ERVV-2B6SEH9 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 UBE2W-203ENST00000517608 8426 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC023394.2-201ENST00000581987 792 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 PTBP2-211ENST00000609116 12014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL033397.1-201ENST00000502390 3653 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
ERVV-2B6SEH9 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms