Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
IMPG1Q17R60 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145 ms