Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RPS29P9-201ENST00000440360 171 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC046136.1-201ENST00000459855 533 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RRM2B-206ENST00000519317 420 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RTN1Q16799 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.1 ms