Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CCNG2P1-201ENST00000549521 1000 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.21□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
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ZNF239Q16600 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZNF239Q16600 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
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