Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ABCA5-208ENST00000588877 6525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCBQ16585 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SGCBQ16585 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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