Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC023141.3-201ENST00000436698 278 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LINC01091-201ENST00000508111 645 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 FRMD3-207ENST00000621208 5064 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
E2F4Q16254 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms