Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

Predictions only

Length 4,861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ZFAND6-223ENST00000616533 1653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC091515.1-201ENST00000548110 679 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HERC1Q15751 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC1.26□□□□□ -2.21
HERC1Q15751 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
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