Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SIX1Q15475 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
SIX1Q15475 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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