Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL512347.1-201ENST00000566420 503 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC013470.4-201ENST00000619978 986 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RAB35Q15286 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms