Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC107398.4-201ENST00000635489 765 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
PSME4Q14997 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PSME4Q14997 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PSME4Q14997 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PSME4Q14997 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 DAOA-AS1_1.1-201ENST00000613021 201 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PSME4Q14997 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
PSME4Q14997 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms