Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC089999.1-201ENST00000460336 374 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
CACNA1CQ13936 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms