Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ATP1A4Q13733 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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