Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC243829.4-202ENST00000610845 410 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PCDH18-201ENST00000344876 5906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 Y_RNA.577-201ENST00000384794 101 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
PKD2Q13563 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
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