Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
ATMQ13315 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
ATMQ13315 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
ATMQ13315 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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