Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL133217.1-201ENST00000450980 425 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
CHAF1AQ13111 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms