Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF1Q13077 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 USP9YP35-201ENST00000435696 412 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
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TRAF1Q13077 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAF1Q13077 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
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