Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CGA-204ENST00000627148 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK2Q13002 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms