Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CPHL1P-201ENST00000461341 3407 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC02500-201ENST00000512547 493 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 LINC00622-201ENST00000562811 1570 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
FOXD4Q12950 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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