Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DCX-207ENST00000635795 9163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MIR3684-201ENST00000579779 74 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RUBCNL-205ENST00000389908 3956 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RIPK1-202ENST00000380409 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZFX-202ENST00000338565 2906 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC011897.1-201ENST00000450715 346 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ANK2-201ENST00000264366 11775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
TRIM35Q9UPQ4 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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