Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
USP35Q9P2H5 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.1 ms