Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL606537.1-201ENST00000607258 2011 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL357140.2-201ENST00000445884 440 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 OR5AQ1P-202ENST00000641257 1534 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NHSL1Q5SYE7 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms