Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 IL36B-201ENST00000259213 1186 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-650P-201ENST00000365658 111 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND3P24-201ENST00000506306 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC253576.2-201ENST00000618815 580 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 CYCSP20-201ENST00000473154 315 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
KRTAP21-3Q3LHN1 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.1 ms