Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL049874.4-201ENST00000557593 255 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ABCC5-AS1-201ENST00000422946 469 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RPL23AP15-201ENST00000450202 459 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
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NEDD8Q15843 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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NEDD8Q15843 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
NEDD8Q15843 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC2.01□□□□□ -2.09
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