Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC026347.1-201ENST00000463255 474 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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VAMP3Q15836 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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VAMP3Q15836 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL445423.1-201ENST00000609941 536 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
VAMP3Q15836 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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