Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL096803.2-201ENST00000450032 677 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
SS18Q15532 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SS18Q15532 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms