Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MECOM-219ENST00000628990 4835 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC099509.1-201ENST00000502437 652 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
PTPRRQ15256 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms