Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
PCOLCEQ15113 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL133268.3-201ENST00000428903 577 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
PCOLCEQ15113 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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