Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZBTB44-210ENST00000530205 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SNORA25.10-201ENST00000515926 124 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 TVP23CP2-201ENST00000571473 623 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DNM3OS-201ENST00000417354 4358 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RPS29P22-201ENST00000472363 168 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
SSPNQ14714 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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