Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC090912.2-203ENST00000581177 477 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PDE6HQ13956 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PDE6HQ13956 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms