Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC087481.2-201ENST00000565492 330 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC097372.4-201ENST00000625025 466 ntBASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC2.56□□□□□ -2
SRSF6Q13247 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157 ms