Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
NME3Q13232 DNAH12-208ENST00000495027 12146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
NME3Q13232 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
NME3Q13232 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms