Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC013410.2-201ENST00000422627 201 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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