Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 GOLT1B-210ENST00000631252 223 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RGS13-204ENST00000543215 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC016687.3-202ENST00000505018 2404 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
GPS1Q13098 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.1 ms