Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 LINC02238-201ENST00000424953 557 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.86
CNTN1Q12860 RABGAP1L-203ENST00000347255 1744 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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CNTN1Q12860 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
CNTN1Q12860 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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