Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TPRKBP1-201ENST00000456243 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL356804.1-201ENST00000553791 448 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
IFFO1Q0D2I5 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms