Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RFC3-202ENST00000434425 1461 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC006946.1-201ENST00000429106 328 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CDH7-201ENST00000323011 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CRNDE-212ENST00000613942 2601 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CU639417.4-201ENST00000623928 207 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PTPREP23469 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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