Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
PTPRDP23468 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106 ms