Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP003730.1-201ENST00000524605 285 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC013437.1-201ENST00000549878 414 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 NCOA1-203ENST00000395856 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms