Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUT4

LRRN4, Leucine-rich repeat neuronal protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN4Q8WUT4 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC026826.3-201ENST00000561747 158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 DTNA-229ENST00000598142 2509 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC138360.1-201ENST00000552332 386 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
LRRN4Q8WUT4 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms