Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC006967.1-201ENST00000467608 589 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL008729.2-201ENST00000606393 473 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 UGP2-229ENST00000613823 1858 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
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USP53Q70EK8 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 AC009248.2-201ENST00000619826 254 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
USP53Q70EK8 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
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