Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

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Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.55□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
UBR3Q6ZT12 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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