Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CEP295-206ENST00000531700 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 IGLCOR22-2-201ENST00000605398 313 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
HIF1AQ16665 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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